La mayoría de los tratamientos también afectan a las células sanas, además de las cancerosas, produciendo así efectos secundarios que dependerán en gran parte de cada paciente.

Cirugía
Provoca malestar e incomodidad los primeros días después de la intervención. Tendrá sensación de cansancio, debilidad, impotencia e incontinencia urinaria.
La intervención para extirpar la próstata puede causar incontinencia urinaria o lesiones en el recto a largo plazo. En algunos casos puede darse impotencia permanente .

Radioterapia
Tendrá sensación de mucho cansancio, caída de cabello en el área tratada, diarrea y dolor al orinar. La radioterapia también puede provocar enrojecimiento, sequedad y flacidez de la parte de la piel tratada .

Terapia hormonal
Los efectos secundarios dependen en gran parte del tipo de tratamiento. Puede producir pérdida del apetito sexual, impotencia, sofocos, aumento de peso, debilidad muscular y anemia .

Terapias biológicas
Algunos de sus efectos secundarios son la fiebre, dolor muscular, debilidad, pérdida de apetito, náuseas, vómito o diarrea .

Espera vigilante
Los pacientes que escogen este tratamiento evitan los efectos secundarios de la cirugía y radioterapia, pero uno de los aspectos más negativos de esta elección es la reducción de las oportunidades de controlar la enfermedad .